Существительные “знамя”, “имя” и “семя” относятся к разносклоняемым словам. Эти слова имеют основу в родительном падеже, а также во многих других падежах.
Например, в родительном падеже единственного числа они склоняются следующим образом: “знамени”, “имени”, “семени”. В дательном падеже единственного числа они склоняются как “знамени”, “имени”, “семени”. В творительном падеже единственного числа они склоняются как “знаменем”, “именем”, “семенем”. В предложном падеже единственного числа они склоняются как “о знамени”, “о имени”, “о семени”.
При склонении этих слов во множественном числе они стремятся к склонению существительных 2-го склонения. Например, в родительном падеже множественного числа они склоняются как “знамен”, “имен”, “семен”. В дательном падеже множественного числа они склоняются как “знаменам”, “именам”, “семенам”. В творительном падеже множественного числа они склоняются как “знаменами”, “именами”, “семенами”. В предложном падеже множественного числа они склоняются как “о знаменах”, “о именах”, “о семенах”.
Таким образом, слова “знамя”, “имя” и “семя” склоняются в разных падежах и числах, согласно правилам русского языка. Они относятся к разносклоняемым словам и имеют основу в родительном падеже.